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College of Biological Science and Engineering

胡桓

发布日期:2024-02-28 发布者:

姓名:胡桓

性别:男

25732


职称:副研究员(校聘)/硕士生导师

学历:博士研究生

电子邮件:huanhu@fzu.edu.cn

研究方向:生物信息学、人工智能、生物医学大数据、深度学习

研究生招生专业:085410人工智能(计算机与大数据爱游戏体育平台罗马赞助商)、083600生物工程、077700生物医学工程、086001生物技术与工程

教育工作经历:

20237月-至今:爱游戏体育平台罗马赞助商,生物科学与工程爱游戏体育平台罗马赞助商,硕士生导师

20189月-20237月:厦门大学,物理科学与技术爱游戏体育平台罗马赞助商,博士

20157月-20189月:辽宁大学,生命科爱游戏体育平台罗马赞助商,硕士

20117月-20159月:辽宁大学,生命科爱游戏体育平台罗马赞助商,本科

教学简介:暂无

本科生课程:暂无

研究生课程:暂无

科研简介:

一、单细胞数据建模与分析:

1.单细胞多模态数据整合建模:研究如何整合不同组学的单细胞数据,构建综合模型以揭示细胞的多样性和功能。

2.细胞发育轨迹推断:探索单细胞数据中的动态变化,推断细胞的发育轨:拖赴嘈妥涞墓。

3.细胞干性分析:研究细胞的干性特征和干细胞功能,揭示其在组织发育和疾病中的作用。

4.细胞类型注释:开发机器学习、深度学习算法对单细胞数据中的细胞类型进行注释和分类。

5.动力学建模分析:构建动态模型来分析细胞系统中的时间序列数据,揭示细胞动力学过程。

6.时空组学数据分析:研究整合时空信息的单细胞组学数据分析方法,揭示组织和器官的动态特征。

二、大数据分析与人工智能算法开发:

1.人工神经网络架构设计:设计和改进人工神经网络的架构,提高其在生物信息学中的应用效果。

2.基于深度学习的生物医学图像建模:利用深度学习算法,研究和开发用于生物医学图像分析和建模的方法。

3.Linux高性能加速集群架构:研究和优化在Linux集群上进行高性能生物信息学数据处理和分析的架构和算法。

三、生物信息学分析软件与流程开发:

1.关联分析模型:开发和应用关联分析模型,揭示基因、变异、表型、疾病之间的关联关系。

2.经典生物信息分析流程:开发和优化转录组、基因组、微生物组等经典生物信息学分析流程,提供高效准确的数据处理和分析方案。

主持科研项目:


代表性论文:

1. Meng R, Yin S, Sun J, Hu H*, Zhao Q*. scAAGA: Single cell data analysis framework using asymmetric autoencoder with gene attention. Comput Biol Med. 2023 Oct;165:107414.(中科院数学与计算生物学1区,IF=6.698,通讯作者

2. Hu H, Feng Z, Lin H, et al., Identifying SARS-CoV-2 infected cells with scVDN, Front. Microbiol., 2023 Jul 10;14:1236653.(中科院生物学2区top,IF=6.064)

3. Hu H, Feng Z, Lin H, et al., Gene function and cell surface protein association analysis based on single-cell multiomics data, Comput. Biol. Med., 2023 Mar 1(中科院数学与计算生物学1区,IF=6.698,Highly Cited Paper)

4. Hu H, Feng Z, Lin H, et al., Modeling and analyzing single-cell multimodal data with deep parametric inference, Brief Bioinform., 2023 Jan 19;24(1):bbad005.(中科院数学与计算生物学1区,IF=13.994)

5. Hu H, Liu R, Zhao C, et al., CITEMOXMBD: A flexible single-cell multimodal omics analysis framework to reveal the heterogeneity of immune cells, RNA Biol, 2022 Jan;19(1):290-304.(中科院生物学3区,IF=4.766)

6. Liu R, Hu H, McNeil M, et al., Dormant Nfatc1 reporter-marked basal stem/progenitor cells contribute to mammary lobuloalveoli formation, iScience, 2022 Feb 26;25(3):103982. (中科院综合性期刊2区,IF=6.107)

7. Hu H, Zhang L, Ai H, et al., HLPI-Ensemble: Prediction of human lncRNA-protein interactions based on ensemble strategy, RNA Biol., 2018;15(6):797-806.(中科院生物学3区,IF=4.766)

授权专利情况:

[1]

获奖情况:


其他


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